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賽默飛ProFlex 3x32梯度PCR系統(tǒng)運(yùn)行時(shí)需要使用哪些耗材和試劑?

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賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)的 ProFlex? 3x32 PCR 系統(tǒng) 是一款高度靈活、可配置的梯度PCR儀(支持三個(gè)獨(dú)立溫區(qū),每個(gè)溫區(qū)可放置不同的模塊,如標(biāo)準(zhǔn)96孔、快速96孔、雙槽384孔等)。根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)需求,運(yùn)行該系統(tǒng)通常需要以下耗材和試劑:


一、賽默飛ProFlex 3x32PCR系統(tǒng)核心耗材

1、PCR板或管:

(1)與模塊匹配的耗材至關(guān)重要。系統(tǒng)支持多種模塊,請(qǐng)根據(jù)您使用的模塊類(lèi)型選擇:

96孔模塊:使用標(biāo)準(zhǔn)的 0.2ml 8聯(lián)排管(PCR條管) 或 96孔PCR板。

384孔模塊:使用專(zhuān)用的 384孔PCR板。

(2)材質(zhì):推薦使用高質(zhì)量、薄壁、光學(xué)透明的聚丙烯材質(zhì),以確保熱傳導(dǎo)和熒光檢測(cè)兼容性(如果后續(xù)需要進(jìn)行qPCR,但ProFlex本身是普通PCR儀)。

2、封蓋材料:

(1)對(duì)于PCR板:

光學(xué)透明封板膜:密封性好,兼容后續(xù)的熒光檢測(cè)(如在其他儀器上做qPCR分析)。

熱封膜:使用熱封儀密封,是防止蒸發(fā)和交叉污染可靠的方式之一。

壓敏型封板膜(可撕式):使用方便,但需確保按壓緊密。

(2)對(duì)于8聯(lián)排管:

平蓋或凸蓋:根據(jù)PCR儀熱蓋類(lèi)型選擇。ProFlex使用自動(dòng)壓力熱蓋,能適應(yīng)不同高度的管蓋,但需確保所有管蓋高度基本一致。

管蓋通常隨管一起購(gòu)買(mǎi)。


二、賽默飛ProFlex 3x32梯度PCR系統(tǒng)核心試劑

1、PCR主反應(yīng)混合物:

(1)預(yù)混液:推薦使用 Taq DNA聚合酶預(yù)混反應(yīng)液(2× PCR Master Mix),其中已包含Taq酶、dNTPs、MgCl?、反應(yīng)緩沖液等。使用方便,重復(fù)性好。例如,賽默飛的 TaqMan® Fast Advanced Master Mix(用于探針?lè)╭PCR的預(yù)混液,也可用于普通PCR)或 Platinum™ Taq DNA Polymerase 系列。

(2)或自行配制:需要單獨(dú)購(gòu)買(mǎi):

耐熱DNA聚合酶(如Taq酶)

10× PCR反應(yīng)緩沖液

氯化鎂

dNTP混合物

2、模板DNA:您要擴(kuò)增的目標(biāo)DNA,濃度和純度需合適。

3、引物:針對(duì)目標(biāo)序列特異設(shè)計(jì)的上游和下游引物,通常以干粉或儲(chǔ)存液形式提供,使用時(shí)稀釋到工作濃度。

4、無(wú)核酸酶水:用于補(bǔ)足反應(yīng)體積,并稀釋模板和引物。務(wù)必使用無(wú)核酸酶的水或TE緩沖液,以避免DNA降解。


三、可選/輔助試劑與耗材

1、陽(yáng)性對(duì)照:含有已知目標(biāo)序列的DNA模板,用于驗(yàn)證PCR體系是否正常工作。

2、陰性對(duì)照:

(1)無(wú)模板對(duì)照:用無(wú)核酸酶水代替模板DNA,用于檢測(cè)試劑或環(huán)境是否存在DNA污染。

(2)無(wú)引物對(duì)照:用等體積水代替引物,用于檢測(cè)模板是否有殘留雜質(zhì)。

3、染料(用于普通PCR終點(diǎn)檢測(cè)):

(1)上樣染料:如果PCR產(chǎn)物后續(xù)需要進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,可在反應(yīng)完成后加入或在配制預(yù)混液時(shí)加入。

(2)在凝膠電泳中顯影的染料:如溴化乙錠、SYBR® Safe等更安全的替代品。

4、用于梯度PCR優(yōu)化的試劑:當(dāng)您使用梯度功能尋找退火溫度時(shí),可能需要準(zhǔn)備多管/多孔的相同反應(yīng)體系,以便在不同溫度下同時(shí)測(cè)試。


四、重要操作提示:

1、模塊與耗材匹配:在開(kāi)機(jī)前,務(wù)必確認(rèn)儀器中安裝的模塊類(lèi)型(可從儀器觸摸屏的“模塊設(shè)置"中查看),并選擇與匹配的耗材。錯(cuò)誤的耗材會(huì)導(dǎo)致熱蓋壓力不均、熱傳導(dǎo)不佳甚至損壞儀器。

2、建立和保存程序:充分利用ProFlex的三區(qū)獨(dú)立梯度功能。您可以為每個(gè)區(qū)設(shè)置獨(dú)立的溫度程序,包括在退火步驟設(shè)置溫度梯度(例如,A區(qū)設(shè)置為58°C,B區(qū)為60°C,C區(qū)為62°C;或每個(gè)區(qū)內(nèi)也可設(shè)置梯度)。程序可以在觸摸屏上輕松創(chuàng)建和保存。

3、防止污染:操作時(shí)務(wù)必佩戴手套,并在專(zhuān)門(mén)的超凈工作臺(tái)或干凈區(qū)域配制反應(yīng)體系,與加模板DNA的區(qū)域分開(kāi)。

4、體系體積:確保反應(yīng)體系體積在推薦范圍內(nèi)(通常20-50μl),并遵循PCR板/管的體積要求。


總結(jié)清單:您每次實(shí)驗(yàn)前需要準(zhǔn)備的是:

匹配模塊的PCR板/管 + 密封膜/蓋 + PCR預(yù)混液 + 模板DNA + 引物 + 無(wú)核酸酶水 + 對(duì)照品 + 移液用品。

TEL:18016231680

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