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使用伯樂T100梯度PCR儀時(shí),除了遵循常規(guī)PCR操作規(guī)范外,還有一些針對該型號儀器的關(guān)鍵細(xì)節(jié)和注意事項(xiàng)。熟練掌握這些細(xì)節(jié)能顯著提高實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性和成功率。以下是從操作前、操作中到操作后的詳細(xì)注意事項(xiàng):
一、BioRad伯樂T100PCR儀 開機(jī)前與程序設(shè)置階段
1、儀器預(yù)熱與校準(zhǔn):
(1)儀器剛開機(jī),建議預(yù)熱10-15分鐘,讓熱蓋和樣品槽溫度穩(wěn)定,確保溫度的準(zhǔn)確性。
(2)定期進(jìn)行溫度校準(zhǔn)(尤其是當(dāng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)系統(tǒng)性偏差時(shí))。這通常需要使用專用的校準(zhǔn)儀或由專業(yè)技術(shù)人員完成。
2、程序設(shè)置與驗(yàn)證:
(1)理解梯度功能: 明確梯度的設(shè)置范圍。T100的梯度功能是在樣品槽的同一排(通常是縱向) 設(shè)置一個(gè)線性溫度梯度。例如,設(shè)置梯度為60°C到50°C,意味著同一排從左到右(或從右到左)溫度線性遞減。請勿在設(shè)置梯度的一排放置不同引物或模板的樣品,否則結(jié)果無法解讀。
(2)合理設(shè)置梯度范圍: 初次進(jìn)行退火溫度優(yōu)化時(shí),梯度范圍可以設(shè)寬一些(如10-12°C)。根據(jù)結(jié)果縮小范圍進(jìn)行精細(xì)優(yōu)化。范圍過寬可能會(huì)超出酶的適宜溫度。
(3)確認(rèn)熱蓋溫度: 根據(jù)使用的管型(如0.2mL單管、八連排管)正確設(shè)置熱蓋溫度。通常使用默認(rèn)的105°C即可,確保管蓋被緊密壓住,防止蒸發(fā)。
(4)程序命名與保存: 為每個(gè)程序設(shè)置一個(gè)清晰易懂的名稱并保存,避免下次使用時(shí)輸錯(cuò)參數(shù)。
二、伯樂T100梯度PCR儀樣品準(zhǔn)備與放置階段
1、樣品管選擇與質(zhì)量:
(1)使用平蓋、薄壁的專用PCR管/板。管壁厚度不均或拱形蓋會(huì)嚴(yán)重影響熱傳導(dǎo),導(dǎo)致溫度不準(zhǔn)和蒸發(fā)。
(2)確保管蓋緊閉。放置前,可以用指尖輕輕按壓每個(gè)管蓋確認(rèn)。
2、反應(yīng)體系配置:
(1)確保反應(yīng)液在管底,不要掛在管壁或蓋上。短暫離心將所有液體收集到管底。
(2)體系體積不宜過小,對于0.2mL的管,建議不少于10μL,以保證溫度感應(yīng)的準(zhǔn)確性。
3、樣品放置的“黃金法則":
(1)對稱放置: 無論是否使用梯度,都盡量將樣品對稱放置在樣品槽中。這有助于熱場均勻,減少邊緣效應(yīng)。
(2)梯度實(shí)驗(yàn)的放置: 進(jìn)行梯度實(shí)驗(yàn)時(shí),必須將同一反應(yīng)體系的多個(gè)重復(fù)樣本,放置在梯度設(shè)置的那一排上。例如,你要優(yōu)化一個(gè)引物的退火溫度,你需要準(zhǔn)備8個(gè)相同的PCR反應(yīng)管,然后全部放在儀器上用于梯度的那一排(通常是縱向的一列),儀器會(huì)自動(dòng)為每個(gè)管分配不同的退火溫度。
(3)非梯度實(shí)驗(yàn)的放置: 即使不做梯度實(shí)驗(yàn),也建議將樣品放在樣品槽中部區(qū)域,避免最外圈,因?yàn)檫吘壍臏囟炔▌?dòng)可能稍大。
(4)標(biāo)記位置: 在放置樣品時(shí),在管蓋或排架上用記號筆標(biāo)記位置(如A1, B2),以便后續(xù)準(zhǔn)確記錄哪個(gè)樣品在哪個(gè)位置。
三、伯樂T100梯度PCR儀運(yùn)行階段
1、運(yùn)行前最終檢查:
(1)再次確認(rèn)程序參數(shù)(溫度、時(shí)間、循環(huán)數(shù))是否正確。
(2)確認(rèn)熱蓋已經(jīng)緊密閉合,聽到“咔嗒"聲。
(3)檢查儀器屏幕顯示的狀態(tài)是否為“Ready"或“Idle"。
2、運(yùn)行中:
(1)儀器運(yùn)行時(shí),請勿頻繁打開熱蓋,這會(huì)嚴(yán)重干擾溫度控制。
(2)注意觀察儀器運(yùn)行是否正常,有無異常報(bào)警聲。T100的屏幕會(huì)顯示當(dāng)前運(yùn)行的步驟和剩余時(shí)間。
四、 運(yùn)行結(jié)束后
1、取回樣品:
(1)程序結(jié)束后,儀器會(huì)自動(dòng)將樣品槽降溫至4°C或12°C(根據(jù)設(shè)置)進(jìn)行保溫。盡快取出樣品,以免冷凝水在管內(nèi)積聚。
(2)取出時(shí)小心燙傷,雖然樣品槽溫度不高,但熱蓋部分可能仍有余溫。
2、數(shù)據(jù)記錄:
這是梯度PCR最關(guān)鍵的一步! 立即記錄下每個(gè)樣品在樣品槽中的精確位置以及該位置對應(yīng)的實(shí)際梯度溫度。你可以在儀器的運(yùn)行日志或程序結(jié)果中找到這個(gè)溫度列表。沒有這個(gè)對應(yīng)關(guān)系,梯度實(shí)驗(yàn)就失去了意義。
3、儀器維護(hù):
(1)保持清潔: 定期用70%乙醇濕潤的無塵紙擦拭樣品槽和熱蓋,去除灰塵、油污和溢出的樣品。切勿使用強(qiáng)酸、強(qiáng)堿或高濃度酒精,以免腐蝕金屬表面。
(2)防止污染: 如果有樣品泄漏,務(wù)必立即清潔,防止基因組DNA或PCR產(chǎn)物交叉污染后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
(3)長期不用: 如果長時(shí)間不使用,請拔掉電源,并用防塵罩蓋好。
總結(jié):
使用伯樂T100的核心在于 “理解梯度、規(guī)范放置、準(zhǔn)確記錄" 。只要在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)時(shí)想清楚如何利用梯度功能,在操作時(shí)細(xì)心規(guī)范,并養(yǎng)成及時(shí)記錄的好習(xí)慣,就能充分發(fā)揮這臺高性能儀器的優(yōu)勢,為您的實(shí)驗(yàn)帶來極大的便利。