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伯樂CFX DUET實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的操作使用方法。這是一款非常經(jīng)典和用戶友好的qPCR儀器,其操作流程主要分為實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備、軟件設(shè)置、運(yùn)行儀器和數(shù)據(jù)分析四個(gè)部分。
一、伯樂CFX DUET實(shí)時(shí)熒光定量pCR儀軟件設(shè)置 - 創(chuàng)建并運(yùn)行一個(gè)實(shí)驗(yàn)
在CFX Maestro軟件主界面,點(diǎn)擊 “新建實(shí)驗(yàn)"。
1、步驟1:設(shè)置實(shí)驗(yàn)類型和檢測(cè)染料
(1)實(shí)驗(yàn)類型:選擇 “定量PCR"。
(2)檢測(cè)模式:
探針法:如果您使用了TaqMan探針等,選擇 FAM 或其他對(duì)應(yīng)熒光基團(tuán)。
染料法:如果您使用了SYBR Green I等染料,選擇 SYBR。
您也可以在一個(gè)實(shí)驗(yàn)中同時(shí)設(shè)置多種檢測(cè)模式(例如,一部分孔用FAM,另一部分用HEX/VIC/JOE),這就是“DUET"名稱的由來(lái),支持雙色檢測(cè)。
2、步驟2:設(shè)置板布局
軟件界面會(huì)顯示一個(gè)虛擬的96孔板圖。
(1)指定樣品類型:
未知樣品:您的待測(cè)樣本。
陽(yáng)性對(duì)照:已知含有目標(biāo)序列的樣品。
陰性對(duì)照:不含模板的樣品(如用水代替),用于檢測(cè)是否有污染。
標(biāo)準(zhǔn)品:用于制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。您需要輸入每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品的已知濃度。
(2)指定目標(biāo)基因:為每個(gè)孔或每組孔指定檢測(cè)的基因名稱(例如,GeneA, ActB)。
(3)指定熒光染料:為每個(gè)孔或每組孔指定所使用的熒光通道(如FAM, SYBR)。
3、步驟3:設(shè)置反應(yīng)程序
這是qPCR反應(yīng)的核心步驟,通常包括三個(gè)階段:
(1)酶激活步驟(可選,取決于預(yù)混液):
溫度:95 °C
時(shí)間:2-10 分鐘
循環(huán)數(shù):1
(2)擴(kuò)增循環(huán)(PCR循環(huán)) - 重復(fù)運(yùn)行40-45個(gè)循環(huán):
變性:
溫度:95 °C
時(shí)間:10-30 秒
退火/延伸:
溫度:55-65 °C(根據(jù)您的引物TM值優(yōu)化)
時(shí)間:30-60 秒
在此步驟末采集熒光信號(hào)。
(3)熔解曲線分析(僅適用于SYBR Green染料法):
程序會(huì)自動(dòng)添加。通常是從65°C緩慢升溫到95°C,在此過程中連續(xù)采集熒光信號(hào),用于確認(rèn)擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性。
(4)步驟4:開始運(yùn)行
檢查所有設(shè)置無(wú)誤后,點(diǎn)擊右上角的 “開始運(yùn)行" 按鈕。
系統(tǒng)會(huì)彈出對(duì)話框,讓您輸入實(shí)驗(yàn)名稱并選擇保存位置。
確認(rèn)后,儀器將開始運(yùn)行程序。您可以在軟件界面上實(shí)時(shí)查看反應(yīng)進(jìn)程、熒光信號(hào)增長(zhǎng)曲線和溫度變化。
二、伯樂CFX DUET實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀運(yùn)行后數(shù)據(jù)分析
1、查看擴(kuò)增曲線:
軟件會(huì)自動(dòng)設(shè)置基線閾值和Ct值。您可以檢查擴(kuò)增曲線是否平滑,S形曲線是否典型。
2、查看熔解曲線(僅SYBR Green法):
確認(rèn)每個(gè)樣品只有一個(gè)單一的尖峰。如果出現(xiàn)多個(gè)峰,可能意味著有引物二聚體或非特異性擴(kuò)增。
3、結(jié)果分析:
相對(duì)定量(常用方法):使用 ΔΔCt法 計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量。您需要指定內(nèi)參基因和對(duì)照組。
定量:如果您使用了標(biāo)準(zhǔn)品,軟件會(huì)自動(dòng)生成標(biāo)準(zhǔn)曲線,并根據(jù)曲線計(jì)算出每個(gè)未知樣品的絕對(duì)拷貝數(shù)或濃度。
4、導(dǎo)出數(shù)據(jù):您可以將結(jié)果(包括圖表和數(shù)據(jù)表格)導(dǎo)出為PDF或Excel文件,用于報(bào)告和進(jìn)一步處理。
三、重要注意事項(xiàng)與日常維護(hù)
1、安全重要性:在運(yùn)行前確保板子或管子已密封,防止生物污染。
2、保持清潔:定期用蘸有70%乙醇的無(wú)塵紙擦拭樣品槽的表面,防止灰塵或污染物影響光學(xué)系統(tǒng)。
3、避免強(qiáng)光直射:將儀器放置在穩(wěn)定、無(wú)振動(dòng)、遠(yuǎn)離強(qiáng)光源和磁場(chǎng)的地方。
4、軟件熟悉:花些時(shí)間熟悉CFX Maestro軟件的各個(gè)功能,它非常強(qiáng)大且直觀。
5、預(yù)混液說(shuō)明書:不同廠家的qPCR預(yù)混液推薦的反應(yīng)程序可能略有不同,請(qǐng)以您所用試劑的說(shuō)明書為準(zhǔn)進(jìn)行微調(diào)。
開機(jī) → 打開CFX Maestro → 新建實(shí)驗(yàn) → 設(shè)置檢測(cè)染料 → 設(shè)置板布局(指定樣品、基因)→ 設(shè)置反應(yīng)程序(激活、變性、退火/延伸、熔解曲線)→ 保存并開始運(yùn)行 → 分析數(shù)據(jù)(擴(kuò)增曲線、熔解曲線、定量)→ 導(dǎo)出報(bào)告