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伯樂Bio-Rad CFX Opus 96實時熒光定量PCR儀的正確操作使用方法。這是一份詳細的、分步驟的操作指南,旨在幫助您安全、準確、高效地使用該儀器。
一、伯樂CX OPUS96實時熒光定量PCR儀實驗前準備
1、儀器準備
開機:打開儀器主機電源,再打開電腦。啟動 CFX Maestro 軟件。儀器會進行自檢,確保所有指示燈正常。
預熱:儀器開機后預熱10-15分鐘,使光學系統(tǒng)和加熱模塊穩(wěn)定。
2、軟件準備
在電腦上雙擊打開 CFX Maestro 軟件。
創(chuàng)建新實驗:點擊 New Experiment 或 Create Experiment。
3、實驗設計
明確您的實驗目的:定量、相對定量(基因表達分析)、基因分型等。
設計好您的實驗布局(板布局),包括:
待測樣品:每個樣品設置技術(shù)重復(通常2-3個)。
標準品(用于定量):一系列已知濃度的DNA/cDNA,用于生成標準曲線。
陰性對照:
無模板對照:反應體系中不加任何模板,用于檢測試劑或環(huán)境是否存在污染。
無逆轉(zhuǎn)錄對照:僅用于基因表達分析,檢測基因組DNA污染。
內(nèi)參基因(用于相對定量):用于校正樣品間的加樣量和RNA質(zhì)量差異。
4、反應體系配制(在冰上或冷卻板上操作)
根據(jù)您的試劑盒說明書或自行優(yōu)化的方案,計算并配制 主混合液。
推薦配制順序:在一個1.5 mL無菌無核酸酶離心管中,按以下順序加入:
無核酸酶水
PCR緩沖液、Mg2?等
dNTPs
引物 和 探針(如使用)
熱啟動DNA聚合酶(最后加入,避免室溫下非特異性擴增)
充分混勻并短暫離心。
將主混合液分裝到PCR板或八聯(lián)管中。
最后在指定的模板添加區(qū)加入模板DNA/cDNA,蓋上管蓋/板膜。
短暫離心PCR板/八聯(lián)管,確保所有液體沉于管底且無氣泡。
二、伯樂CFX OPUS96實時熒光定量PCR儀上機操作流程
1、步驟1:放置樣品
打開儀器的樣品槽門。
如果是96孔板:將其平穩(wěn)地放入樣品槽中,確保板子放置平整,A1孔位于左上角。
如果是八聯(lián)管:確保所有管子擺放整齊,卡在支架上,位置正確。
輕柔地關(guān)上樣品槽門。
2、步驟2:在CFX Maestro軟件中設置實驗
(1)選擇檢測類型:
點擊 Assay -> Select。
對于SYBR Green I染料:選擇 SYBR® Green。
對于TaqMan探針:選擇 FAM 或其他相應的熒光染料。
對于HRM分析:選擇 HRM。
(2)設置板布局:
在虛擬的96孔板界面上,用鼠標拖動選擇孔位。
為選中的孔位指定 樣品名稱 和 任務。
任務類型包括:
Unknown:未知樣品。
Standard:標準品,并需要輸入其濃度。
NTC:無模板對照。
Positive Control:陽性對照。
(3)編輯實驗協(xié)議:
點擊 Protocol 進入編輯界面。一個典型的qPCR程序包括三個階段:
a. 預變性/熱啟動:
溫度:95°C
時間:2-5分鐘(根據(jù)酶的要求,激活熱啟動酶并確保模板變性)。
b. 擴增循環(huán)(重復40-45個循環(huán)):
變性:95°C,10-30秒。
退火/延伸:60°C(常用),30-60秒。在此步驟采集熒光信號。
注意:如果引物Tm值較低,可能需要分開設置退火和延伸步驟。
c. 熔解曲線分析(僅適用于SYBR Green I):
儀器會自動生成一個標準熔解曲線程序,通常為:
95°C,10秒
65°C,5秒
然后從65°C緩慢升溫到95°C,每0.5°C采集一次熒光信號。
3、步驟3:啟動運行
保存實驗文件:為您的實驗命名并保存(.pcrd 文件)。
點擊 Start Run。
軟件會彈出一個對話框,讓您再次確認板布局和實驗協(xié)議。確認無誤后,點擊 開始。
儀器將開始運行,您可以在軟件界面上實時查看反應進程、擴增曲線和溫度狀態(tài)。
三、伯樂CFX OPUS96實時熒光定量PCR儀運行后數(shù)據(jù)分析
1、查看擴增曲線:
確保所有陽性樣品的擴增曲線呈標準的“S"型,基線平穩(wěn),指數(shù)期明顯。
檢查NTC對照是否有擴增信號(應無或Ct值>35),如有則表明存在污染。
2、查看熔解曲線(SYBR Green I):
確保每個樣品只有一個單一的、尖銳的峰。出現(xiàn)多個峰或?qū)挿灞砻饔幸锒垠w或非特異性擴增。
3、進行定量分析:
定量:軟件會根據(jù)標準品自動生成標準曲線(R2 > 0.99,效率在90%-110%之間為佳),并計算出未知樣品的起始拷貝數(shù)或濃度。
相對定量(ΔΔCt法):
軟件會先計算每個樣品的內(nèi)參基因(管家基因)和目標基因的Ct值。
然后通過 ΔCt = Ct(目標基因) - Ct(內(nèi)參基因),ΔΔCt = ΔCt(實驗組) - ΔΔCt(對照組),最終計算出 2^(-ΔΔCt),即基因表達的相對倍數(shù)變化。
4、導出數(shù)據(jù):可以將圖表和數(shù)據(jù)(如Ct值、濃度等)導出為Excel或PDF格式,用于報告和存檔。