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伯樂(Bio-Rad)的 CFX Opus 96 是一款高性能、高通量的實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。核心功能是進(jìn)行qPCR 實(shí)驗(yàn),但憑借其精確的溫控、靈敏的光學(xué)檢測系統(tǒng)和靈活的軟件,它可以完成多種基于PCR實(shí)驗(yàn)。以下是CFX Opus 96可以進(jìn)行的主要實(shí)驗(yàn)類型,從常見到專業(yè)的:
一、伯樂CFX Opus 96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀基礎(chǔ)應(yīng)用
1、基因表達(dá)分析
這是廣泛的應(yīng)用。 通過檢測樣本中特定mRNA的量,來研究基因在何種條件下、在哪些組織或細(xì)胞中表達(dá)。
應(yīng)用實(shí)例:研究癌癥組織中某個(gè)癌基因的表達(dá)是否上調(diào);比較藥物處理前后細(xì)胞中炎癥因子基因的表達(dá)變化。
2、病原體檢測與鑒定
高靈敏度和特異性使其成為檢測病毒、細(xì)菌、真菌等病原體的黃金標(biāo)準(zhǔn)。
應(yīng)用實(shí)例:新冠病毒、流感病毒、HPV病毒分型、食品安全中的致病菌檢測等。
3、轉(zhuǎn)基因成分檢測
定性或定量檢測食品、飼料或植物樣本中是否含有轉(zhuǎn)基因成分。
4、SNP分型
檢測單核苷酸多態(tài)性,用于基因突變分析、藥物基因組學(xué)、遺傳病篩查等。通常需要使用特定的探針或染料。
二、伯樂CFX Opus 96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀高級(jí)應(yīng)用
1、數(shù)字PCR
注意:CFX Opus 96本身是一臺(tái)qPCR儀。但要進(jìn)行定量的數(shù)字PCR,需要額外配備伯樂的QX200 Droplet Digital PCR系統(tǒng)。流程是:先用QX200系統(tǒng)生成微滴并完成PCR擴(kuò)增,然后將96孔板放到CFX Opus 96上進(jìn)行終點(diǎn)熒光檢測,最后通過軟件分析每個(gè)微滴的熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)定量。所以,它可以作為ddPCR工作流中的一個(gè)組成部分。
2、高分辨率熔解曲線分析
CFX Opus 96具有出色的熔解曲線分析功能,可以:
基因分型:區(qū)分不同的基因型,如突變型、野生型和雜合型。
突變掃描:檢測PCR產(chǎn)物中是否存在未知的突變或單堿基差異。
甲基化分析:結(jié)合重亞硫酸鹽處理,可以用于DNA甲基化水平的研究。
3、microRNA表達(dá)分析
由于miRNA分子非常短,需要特殊的莖環(huán)法引物或加尾法來進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄和qPCR。CFX Opus 96的高靈敏度使其非常適合檢測這種低豐度、小片段的RNA。
4、多重PCR
在一個(gè)反應(yīng)管內(nèi)同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)基因。這要求儀器具有多個(gè)、且光譜不重疊的熒光通道。CFX Opus 96通常配置有3-5個(gè)熒光通道,可以輕松進(jìn)行雙重、三重甚至更多重的qPCR實(shí)驗(yàn),大大提高效率和節(jié)省樣本。
三、總結(jié)
伯樂CFX Opus 96 PCR儀的核心能力可以概括為:
1、高精度定量:不僅能判斷“有或無",還能精確知道“有多少"。
2、高靈敏度:可以檢測極微量的核酸樣本。
3、高特異性:通過探針法和熔解曲線分析,確保檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。
4、高通量:96孔板格式適合中等通量的篩選和驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。
5、多功能性:通過不同的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和試劑盒,可以實(shí)現(xiàn)從基礎(chǔ)的基因表達(dá)到高級(jí)的突變分析等多種應(yīng)用。
在選擇實(shí)驗(yàn)方案時(shí),您需要根據(jù)具體的研究目標(biāo),搭配相應(yīng)的試劑盒、引物和探針,并利用CFX Maestro軟件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分析。對(duì)于定量的數(shù)字PCR,請(qǐng)記住需要配合QX200系統(tǒng)使用。