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thermo賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR系統(tǒng)可做哪些實驗?

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QuantStudio 1是一款基礎(chǔ)、緊湊且易于使用的實時熒光定量PCR儀,其核心功能是進(jìn)行精確的核酸定量和檢測。 它是一款非常適合常規(guī)分子生物學(xué)實驗室的入門級或主力機型。以下是它可以完成的主要實驗類型,從常見到更高級的應(yīng)用:


一、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR核心與常用應(yīng)用

1、基因表達(dá)分析

描述:這是qPCR經(jīng)典的應(yīng)用。通過檢測特定基因的mRNA轉(zhuǎn)錄本水平,來研究基因在不同條件(如藥物處理、疾病狀態(tài)、不同組織、不同發(fā)育階段)下的表達(dá)量變化。

實驗流程:通常需要先將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,再進(jìn)行qPCR。

輸出結(jié)果:相對定量(如2^-ΔΔCt法),比較處理組與對照組的基因表達(dá)差異。

2、定量

描述:用于精確測定樣品中特定DNA或RNA序列的拷貝數(shù)或濃度。

實驗流程:需要構(gòu)建一個已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品(通常是質(zhì)粒DNA或合成的寡核苷酸)梯度曲線,通過待測樣品的Ct值與標(biāo)準(zhǔn)曲線對比,計算出量。

輸出結(jié)果:拷貝數(shù)/微升、克當(dāng)量等。

3、微生物檢測與病原體鑒定

描述:快速、靈敏地檢測樣品中是否存在特定的病原體(如病毒、細(xì)菌、真菌)。這在臨床診斷、食品安全和環(huán)境監(jiān)測中非常重要。

例子:病毒載量檢測(如HPV、HIV、流感病毒)、食源性致病菌(如沙門氏菌、李斯特菌)的篩查。

4、基因分型

描述:利用等位基因特異性探針或染料,鑒別樣本的基因型,例如單核苷酸多態(tài)性(SNP)、插入/缺失突變等。

應(yīng)用:遺傳病篩查、藥物基因組學(xué)、法醫(yī)學(xué)鑒定、轉(zhuǎn)基因生物檢測等。


二、賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR其他支持的應(yīng)用

1、高分辨率熔解曲線分析

描述:在PCR結(jié)束后,通過緩慢升溫并監(jiān)測熒光信號的變化,根據(jù)DNA片段熔解溫度(Tm)的差異來區(qū)分不同的序列。QuantStudio 1支持HRM功能。

應(yīng)用:

SNP分型:無需特異性探針,成本較低。

突變掃描:快速篩查未知突變。

甲基化分析:經(jīng)過重亞硫酸鹽處理的DNA,其甲基化狀態(tài)會影響Tm值。

2、microRNA表達(dá)分析

描述:由于miRNA片段很短,需要特殊的莖環(huán)結(jié)構(gòu)引物或加尾法來進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和擴增,但其核心檢測原理依然是qPCR。QuantStudio 1可以勝任。

3、細(xì)胞因子表達(dá)譜分析

描述:在免疫學(xué)研究中,同時檢測多種細(xì)胞因子mRNA的表達(dá)水平,以了解免疫反應(yīng)的狀態(tài)。


三、技術(shù)特點與優(yōu)勢

1、檢測化學(xué):支持SYBR Green I 染料法和TaqMan 探針法。這兩種是最主流的qPCR化學(xué)方法,覆蓋了絕大多數(shù)應(yīng)用場景。

2、通量:通常配備96孔板模塊,一次最多可運行96個反應(yīng)。

3、軟件:配備直觀的QuantStudio Design and Analysis 軟件,可輕松進(jìn)行實驗設(shè)置、數(shù)據(jù)采集和結(jié)果分析(包括相對定量、定量、熔解曲線分析和基因分型)。

4、緊湊設(shè)計:占地面積小,非常適合空間有限的實驗室。


四、總結(jié)

賽默飛QuantStudio 1實時熒光定量PCR系統(tǒng)是一款功能全面、可靠耐用的基礎(chǔ)型qPCR儀。

1、它非常適合進(jìn)行:

常規(guī)的基因表達(dá)差異分析

病原體定量

基礎(chǔ)的SNP分型和突變掃描

教學(xué)和標(biāo)準(zhǔn)化質(zhì)檢流程

2、它的局限性(與更高階型號相比):

通常只有一個熒光檢測通道,因此不能進(jìn)行多重PCR(即在一個反應(yīng)管內(nèi)同時檢測多個目標(biāo)基因)。高階型號如QuantStudio 3/5/7有多個通道。

不具備更復(fù)雜的溫區(qū)模塊,如FlexFlex模塊。

通量固定為96孔,無法像384孔板那樣實現(xiàn)超高通量。


如果您的研究主要涉及上述核心應(yīng)用,且不需要多重檢測,那么QuantStudio 1是一個非常經(jīng)濟和高效的選擇。

TEL:18016231680

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