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技術(shù)文章QuantStudio 3 是一款緊湊、經(jīng)濟(jì)的96孔板qPCR儀,非常適合常規(guī)的基因表達(dá)分析、病原體檢測(cè)和基因分型等應(yīng)用。其特點(diǎn)是操作簡(jiǎn)便,軟件直觀。
一、賽默飛QuantStudio3實(shí)時(shí)熒光定量PCR主要技術(shù)參數(shù)
尺寸(長(zhǎng)寬高) 27 cm x 50 cm x 40 cm
重量 35 kg
溫度范圍 4-100°C
運(yùn)行時(shí)間 <30min
通道 4個(gè)熒光通道
樣本體積 10-100 μL
變溫速率(模塊、樣本) 6.5°C/秒 3.66°C/秒
容量 1 x 96孔-0.1 ml
顯示器 8英寸彩色 TFT LCD 觸摸屏
激發(fā)檢測(cè)范圍 500-640 nm
產(chǎn)地 美國(guó)
關(guān)鍵參數(shù)解讀:
1、4通道:意味著一次運(yùn)行最多可以同時(shí)檢測(cè)4個(gè)不同的靶基因(使用不同熒光染料標(biāo)記的探針)或者進(jìn)行多色熔解曲線分析。
2、LED光源與CCD檢測(cè):這種設(shè)計(jì)使其光學(xué)系統(tǒng)非常穩(wěn)定耐用,無(wú)需像鹵鎢燈那樣定期更換。
3、快速的升降溫速率:可以顯著縮短PCR循環(huán)時(shí)間,提高實(shí)驗(yàn)效率。
二、賽默飛QuantStudio3實(shí)時(shí)熒光定量PCR使用說(shuō)明書(shū)
1、創(chuàng)建新實(shí)驗(yàn)
在軟件主界面點(diǎn)擊 "New Experiment" (新建實(shí)驗(yàn))。
2、選擇實(shí)驗(yàn)類(lèi)型:
(1)Standard Curve (Absolute Quantification):定量,用于計(jì)算樣品中模板拷貝數(shù)。
(2)Comparative ΔΔCt (Quantitation):相對(duì)定量,用于分析基因的相對(duì)表達(dá)水平。
(3)Melt Curve:熔解曲線,用于鑒定PCR產(chǎn)物的特異性或進(jìn)行基因分型。
(4)Genotyping:基因分型,專(zhuān)門(mén)用于等位基因判別。
3、設(shè)置實(shí)驗(yàn)板:
(1)軟件會(huì)顯示一個(gè)虛擬的96孔板界面。
(2)用鼠標(biāo)選中孔位,在右側(cè)面板為其分配 "Sample Type" (樣品類(lèi)型),如 Unknown, Standard, NTC等。
(3)為每個(gè)孔分配 "Target" (檢測(cè)目標(biāo)),例如 Gene A, Gene B, 內(nèi)參基因等。你需要先創(chuàng)建這些目標(biāo)。
(4)為每個(gè)"Target"選擇對(duì)應(yīng)的 "Dye" (熒光染料),如 FAM, VIC, ROX, CY5 等。
三、程序設(shè)置
點(diǎn)擊 "Protocol" 選項(xiàng)卡,設(shè)置PCR循環(huán)程序。一個(gè)典型的qPCR程序包括:
1、階段1:UNG酶孵育 (可選,防污染)
溫度:50°C
時(shí)間:2分鐘
2、階段2:預(yù)變性 (Hot Start)
溫度:95°C
時(shí)間:2-10分鐘 (根據(jù)酶的要求)
3、階段3:PCR循環(huán) (40-45個(gè)循環(huán))
變性:95°C, 15秒
退火/延伸:60°C, 1分鐘 (此步驟需根據(jù)引物Tm值優(yōu)化)
在此步驟末采集熒光信號(hào) (對(duì)于SYBR Green等染料法)。
4、階段4:熔解曲線分析 (可選,用于SYBR Green實(shí)驗(yàn))
95°C, 15秒
60°C, 1分鐘
從60°C緩慢升溫到95°C (例如,0.05°C/秒),并持續(xù)采集熒光信號(hào)。
四、重要注意事項(xiàng)與維護(hù)
1、光學(xué)校準(zhǔn):建議定期(如每季度或更換實(shí)驗(yàn)場(chǎng)所后)運(yùn)行光學(xué)校準(zhǔn)程序,以確保所有熒光通道的檢測(cè)準(zhǔn)確性。
2、背景熒光校準(zhǔn):在創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)時(shí),可以選擇運(yùn)行"Background Calibration"(背景校準(zhǔn)),以消除板子和試劑的本底熒光。
3、ROX參比染料:根據(jù)你所使用的qPCR預(yù)混試劑類(lèi)型,在設(shè)置"Dye"時(shí),需要正確選擇是否需要ROX染料作為內(nèi)參,以及其濃度級(jí)別(如 Passive Reference ROX, ROX Low, ROX High)。
4、清潔維護(hù):定期用柔軟的干布清潔儀器表面和樣品槽。如果發(fā)生污染,可用70%乙醇輕微濕潤(rùn)的無(wú)絨布擦拭。
5、數(shù)據(jù)備份:定期備份實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。